La vegetazione di tipo mediterraneo copre con i boschi e i prati tutto il territorio di Sant’Apollinare, conferendogli un aspetto ridente e insieme riposante. La vallata è delimitata da due catene di Monti, una di queste è quella dei Monti Aurunci. Questa Vallata si presenta ricca di selve e di boschi, piccole praterie e terre coltivate. A Sant’Apollinare sono state realizzate delle opere che consentono di godere a pieno della natura: è possibile attraverso il "Percorso naturalistico Montebarruzza" fare delle lunghe passeggiate ed ammirare la sottostante piana del Liri, organizzare delle scampagnate e sostare lungo il percorso grazie alla presenza di gazebo, tavoli e panche. Altro bellissimo spettacolo faunistico è quello offerto dal Percorso Pedemontano che collega i comuni di Sant’Apollinare e di Vallemaio, anche qui è possibile fare delle lunghe passeggiate e sostare per scampagnate. Particolare attrattiva per i geologi ha la parte detta la Muraglia: lungo una trincea stradale, alta tra i due e quattro metri, che taglia la collina tra la quota di 40 e 50 metri sul livello del mare, si segue distintamente una successione di litotipi di ambiente lacustre, facente parte del margine sudorientale dell’”Antico lago Lirino”.