E' la prima chiesa costruita nel mondo in onore del Santo. La sua costruzione iniziò tra gli anni 1323 (anno in cui il papa Giovanni XXII elevò Tommaso agli onori dell'altare) e il 1325 (data ricavata da un elenco di chiese tenute a pagare le decime di quell'anno). Sorge a metà strada tra il borgo medievale e il Castello e ha forma rettangolare (lunga circa 20 mt, e larga 10), divisa in due da un grandissimo arco a sesto acuto. Vi sono affreschi del '400, un busto in legno di San Tommaso del 1633. Molti altri affreschi sono andati perduti durante l'ultima guerra. La chiesa è stata completamente restaurata negli anni '70.